在整个基地下方，雷神山医院按垃圾填埋场标准铺设HDPE防渗膜。HDPE防渗膜作为一种柔性防水材料，具有很高的防渗系数（1×10~17cm/s）及良好的耐热性和耐寒性，其使用环境温度为高温110℃、低温-70℃，能耐80余种强酸、碱等化学腐蚀，长时间裸露仍能保持原来的性能。防渗膜的铺设犹如给医院地块穿上“防护衣”，确保地上构筑物与地下水和土壤的物理隔离。
火神山医院铺设土工布和HDPE防渗膜，3万平方米HDPE防渗膜为火神山医院2.5万平方米的地下基础穿上“防护衣”，确保不让一滴污水进入地下。
HDPE防渗膜选材、检测及施工主要参照技术标准：《土工合成材料聚乙烯土工膜》、《聚乙烯（PE）土工膜防渗工程技术规范》、《土工合成材料应用技术规范》、《土工合成材料测试规程》、《垃圾填埋场用高密度聚乙烯土工膜》。防渗设计中HDPE防渗膜材料的主要性能应满足下表要求：
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